ECTS credits ECTS credits: 3
ECTS Hours Rules/Memories Student's work ECTS: 48 Hours of tutorials: 3 Expository Class: 12 Interactive Classroom: 12 Total: 75
Use languages Spanish, Galician
Type: Ordinary Degree Subject RD 1393/2007 - 822/2021
Departments: Microbiology and Parasitology
Areas: Parasitology
Center Faculty of Medicine and Dentistry
Call: Second Semester
Teaching: With teaching
Enrolment: Enrollable
La INTRODUCCION A LA BIOINFORMATICA MEDICA es una materia optativa del Grado de Medicina que tiene como objetivo proporcionar a los alumnos conocimiento sobre el fundamento y usos de las herramientas bioinform谩ticas con el fin de poder obtener, analizar, organizar, e interpretar la informaci贸n biom茅dica.
Temario Desarrollado
CLASES EXPOSITIVAS
a) BIOINFOM脕TICA B脕SICA
Tema 1. Introducci贸n a la bioinform谩tica.
Tema 2. Bases de datos.
Tema 3. B煤squeda de informaci贸n cient铆fica.
Tema 4. Gesti贸n de la bibliograf铆a en Biomedicina.
Tema 5. Algoritmos de clasificaci贸n.
Tema 6. Alineamientos simples.
Tema 7. Alineamientos m煤ltiples.
B) BIOINFORM脕TICA APLICADA
Temas 8-10. Bioinform谩tica aplicada al an谩lisis estructural de DNA, RNA y prote铆nas.
Tema 11. Bioinform谩tica aplicada al diagn贸stico molecular: Identificaci贸n de prote铆nas y microorganismos mediante espectrometr铆a de masas.
Tema 12. Bioinform谩tica aplicada al diagn贸stico molecular: B煤squeda de lugares de restricci贸n. PCR. B煤squeda de mutaciones en bases de datos.
CLASES INTERACTIVAS DE LABORATORIO
P1-P2. B煤squeda de informaci贸n y manejo de bibliograf铆a en Biomedicina.
P3-P4. Manejo de gestores bibliogr谩ficos.
P5-6. B煤squeda de informaci贸n en bases de datos biol贸gicas.
P7. Bioqu铆mica in silico. An谩lisis de la estructura primaria de las prote铆nas. Motivos y repeticiones.
P8. Alineamientos simples. Alineamientos gr谩ficos.
P9. Alineamientos m煤ltiples. Creaci贸n de WebLogos.
P10. Predicci贸n de genes.
P11. Identificaci贸n y caracterizaci贸n de prote铆nas y microorganismos empleando datos de huella pept铆dica y bases de datos especializadas.
P12. An谩lisis estructural 2D/3D de prote铆nas.
P13-14. An谩lisis de secuencias de DNA y RNA. Dise帽o de cebadores para PCR. B煤squeda de lugares de restricci贸n.
P15. Tecnolog铆a RNA-seq. B煤squeda de mutaciones en bases de datos.
BIBLIOGRAFIA:
- Pevsner, J. (2009): "Bioinformatics and Functional Genomics", Wiley-Blackwell.
-David A. Hendriz. 鈥淎pplied Bioinformatics鈥 (2018). Disponible en:
- Buehler, L.K. and Rashidi, H.H. 鈥淏ioinformatics basics: applications in biological science and medicine鈥, Taylor & Francis , USA, Boca Raton, Florida, 2005, pp 335. (Disponible en la 奇趣腾讯分分彩, Facultad de Biolog铆a).
-Jing Xiong (2006) 鈥淓ssential Bioinformatics鈥. Cambridge University Press.
BIBLIOGRAFIA COMPLEMENTARIA:
- Lee, J.K. (ed.) (2010): "Statistical Bioinformatics", Wiley-Blackwell.
- Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame (2006). Bioinformatics For Dummies. John Wiley & Sons.
GENERALES:
- Entender la necesidad de utilizar las herramientas bioinform谩ticas en la medicina actual.
- Conocer las herramientas Bioinform谩ticas habituales empleadas en el manejo de informaci贸n biom茅dica.
ESPECIFICAS:
- Aprender a buscar informaci贸n bibliogr谩fica en Medicina.
-Aprender a utilizar gestores bibliogr谩ficos.
- Aprender a buscar y gestionar informaci贸n contenida en bases de datos de gen贸mica y prote贸mica.
- Aprender a hacer an谩lisis comparativos y/o predictivos de secuencias gen贸micas y prote贸micas.
-Aprender a usar herramientas simples de diagn贸stico molecular.
La materia ser谩 fundamentalmente pr谩ctica y se basar谩 en ejemplos de la literatura cient铆fica.
Se impartir谩n Clases Expositivas (12 horas), Clases Interactivas de Laboratorio (15 horas) y Tutorias (3 horas).
La calificaci贸n final de la materia se obtendr谩 mediante un proceso de evaluaci贸n continua. La nota final se obtendr谩 sumando la calificaci贸n obtenida por el alumno en las clases expositivas (10%), interactivas (60%), y la obtenida en un examen final tipo test (30%) que consistir谩 en un examen tipo test multirespuesta.
En general, por cada hora expositiva e interactiva es conveniente dedicar una hora m谩s de trabajo personal del alumno.
Para superar con 茅xito la materia el alumno debe obtener una puntuaci贸n m铆nima de 5.0, puntos de acuerdo con el sistema de puntuaci贸n arriba indicado. Para ello es altamente recomendable la asistencia a la mayor铆a de las cases expositivas e interactivas.
Jose Manuel Leiro Vidal
- Department
- Microbiology and Parasitology
- Area
- Parasitology
- Phone
- 881814893
- Category
- Professor: University Professor
Fernanda Romaris Martinez
Coordinador/a- Department
- Microbiology and Parasitology
- Area
- Parasitology
- Phone
- 881815247
- fernanda.romaris [at] usc.es
- Category
- Professor: University Lecturer
Seila Couso Perez
- Department
- Microbiology and Parasitology
- Area
- Parasitology
- seila.couso.perez [at] usc.es
- Category
- Professor: Intern Assistant LOSU
| Tuesday | |||
|---|---|---|---|
| 08:30-10:30 | Grupo /CLE_01 | Spanish | Medicine-Classroom 2 |
| 15:30-17:30 | Grupo /CLE_02 | Spanish | Medicine-Classroom 2 |
| Wednesday | |||
| 08:30-10:30 | Grupo /CLE_01 | Spanish | Medicine-Classroom 2 |
| 15:30-17:30 | Grupo /CLE_02 | Spanish | Medicine-Classroom 2 |
| Thursday | |||
| 08:30-10:30 | Grupo /CLE_01 | Spanish | Medicine-Classroom 2 |
| 15:30-17:30 | Grupo /CLE_02 | Spanish | Medicine-Classroom 2 |
| Friday | |||
| 08:30-10:30 | Grupo /CLE_01 | Spanish | Medicine-Classroom 2 |
| 15:30-17:30 | Grupo /CLE_02 | Spanish | Medicine-Classroom 2 |
| 05.14.2025 12:00-14:30 | Grupo /CLE_01 | Medicine-Classroom 2 |
| 05.14.2025 12:00-14:30 | Grupo /CLE_01 | Medicine-Classroom 3 |
| 05.14.2025 12:00-14:30 | Grupo /CLE_01 | Medicine-Classroom 4 |
| 05.14.2025 12:00-14:30 | Grupo /CLE_01 | Medicine-Classroom 5 |
| 05.14.2025 12:00-14:30 | Grupo /CLE_01 | Medicine-Classroom 7 |
| 05.14.2025 12:00-14:30 | Grupo /CLE_01 | Medicine-Classroom 8 |
| 06.19.2025 09:30-11:30 | Grupo /CLE_01 | Medicine-Classroom 4 |