ECTS credits ECTS credits: 6
ECTS Hours Rules/Memories Hours of tutorials: 3 Expository Class: 27 Interactive Classroom: 21 Total: 51
Use languages Spanish, Galician
Type: Ordinary Degree Subject RD 1393/2007 - 822/2021
Departments: Organic Chemistry, Mathematics
Areas: Organic Chemistry, Geometry and Topology
Center Faculty of Biology
Call: First Semester
Teaching: With teaching
Enrolment: Enrollable
- Acceder y manejar la informaci贸n contenida en las principales bases de datos en bioinform谩tica.
- Saber analizar y manejar secuencias de nucle贸tidos y amino谩cidos.
- Saber realizar alineamientos, ensamblajes y relaciones de filogenia entre secuencias.
- Conocer y saber utilizar los m茅todos de an谩lisis de expresi贸n g茅nica.
- Utilizar las herramientas bioinform谩ticas para el an谩lisis estructural y funcional de mol茅culas
Bases de datos (5 CLE)
Acceso y manejo de la informaci贸n contenida en los principales bases de datos 鈥溍砿icos鈥 (gen贸micos, transcript贸micos, prote贸micos, epigen贸micos), de expresi贸n g茅nica, etc.
An谩lisis y manejo de secuencias (5 CLE)
Algoritmos y programas de alineamiento de secuencias de nucle贸tidos y de proteinas. alineamiento de genomas, alineamiento de lecturas frente a un genoma, etc. Ideas de ensamblado de genomas. Diferentes m茅todos para la reconstrucci贸n de 谩rboles y redes filogen茅ticas mediante el uso de secuencias de ADN.
An谩lisis de datos de expresi贸n g茅nica (5 CLE).
Los diferentas tipos de datos existentes (Microarrays, RNA-Seq, etc). Algunos de los m茅todos y programas estad铆sticos m谩s utilizados para su an谩lisis. Generaci贸n de listas de genes con expresi贸n diferencial.
Bioinform谩tica funcional. (5 CLE)
An谩lisis de pathways y redes g茅nicas. El uso de los t茅rminos GO para el an谩lisis funcional. Utilizaci贸n de herramientas bioinform谩ticas dise帽adas para ello.
Bioinform谩tica estructural (10 CLE)
Principios b谩sicos de estructura de biomol茅culas. An谩lisis de estructura de prote铆nas. Clasificaci贸n estructural de prote铆nas: Bases de datos. Nociones elementales de modelizaci贸n molecular. Predicci贸n de la estructura de prote铆nas. Dise帽o de f谩rmacos por ordenador
Temario de otras actividades (pr谩cticas, seminarios, tutor铆as, etc)
An谩lisis y manejo de secuencias de nucle贸tidos y prote铆nas (8 CLIL)
Pr谩ctica 1: Obtenci贸n de datos de diferentes tipos a partir de bases bioinform谩ticas. Almacenamiento y edici贸n de los mismos con un software de manejo de texto plano.
Pr谩ctica 2 Utilizaci贸n de un programa de alineamiento m煤ltiple y reconstrucci贸n filogen茅tica
An谩lisis de datos de expresi贸n g茅nica y Bioinform谩tica funcional (8 CILL)
Pr谩ctica 3 Manejo de un software estad铆stico adecuado para los an谩lisis de expresi贸n g茅nica y generaci贸n de listas de genes expresados de manera diferencial.
Pr谩ctica 4 Acceso a las herramientas b谩sicas de an谩lisis de pathways y an谩lisis funcional.
Pr谩ctica 5 An谩lisis enriquecido de expresi贸n g茅nica y b煤squedas de t茅rminos GO
Bioinform谩tica estructural (4 CLIL)
Pr谩ctica 6.- Construcci贸n y visualizaci贸n de mol茅culas por ordenador.
Pr谩ctica 7.- Introducci贸n a la simulaci贸n computacional enfocada al dise帽o de f谩rmacos.
-Bioinformatics and Functional Genomics, 3rd Edition. Jonathan Pevsner, October 2015 Wiley-Blackwell
-Bioinformatics and Computational Biology Solutions Using R and Bioconductor. Editors Robert GentlemanVincent J. CareyWolfgang HuberRafael A. IrizarrySandrine Dudoit 2005 Springer (recurso online de la B奇趣腾讯分分彩)
-Analysis of Phylogenetics and Evolution with R, Paradis, Emmanuel 2012 Springer (recurso online de la B奇趣腾讯分分彩)
-Molecular Modelling. Principles and Applications (Ed Pearson Education, 2001), Andrew R. Leach
-Introduction to Computational Chemistry (Ed Wiley), Frank Jensen.
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-Material depositado en el aula virtual.
Conocimientos: Con02 y Con04.
Habilidades/Destrezas: H/D02, H/D10 y H/D13
Competencias: Comp03 y Comp05
La docencia expositiva ser谩 presencial, de asistencia obligatoria y consistir谩 en la impartici贸n de clases magistrales
La docencia interactiva ser谩 presencial, de asistencia obligatoria y consistir谩 en pr谩cticas en aula de inform谩tica.
Las tutor铆as en grupos reducidos ser谩n presenciales y se dedicar谩n a la resoluci贸n de dudas.
La calificaci贸n final de materia se obtendr谩 mediante evaluaci贸n continua (50%) y examen final (50%)
Para la evaluaci贸n continua, se valorar谩 la realizaci贸n de trabajos por parte de los estudiantes. En el caso en que la evaluaci贸n continua fuese suficientemente satisfactoria, podr铆a substituir al examen final.
En la segunda oportunidad, se emplear谩 el mismo sistema de evaluaci贸n: presentaci贸n de trabajos y examen final.
Tanto la exposici贸n de los trabajos como el examen final ser谩n presenciales.
Tanto en la evaluaci贸n continua como en el examen final se evaluar谩n las siguiente competencias, habilidades y conocimientos:
Comp02, Comp04, H/D02, H/D10, HD13 Con02 y Con04.
Advertencia. Para los casos de realizaci贸n fraudulenta de ejercicios o pruebas (plagios o uso indebido de las tecnolog铆as) ser谩 de aplicaci贸n el recogido en la 鈥淣ormativa de evaluaci贸n del rendimiento acad茅mico dos estudiantes y de revisi贸n de cualificaciones鈥.
Tiempo de estudio y trabajo personal
TRABAJO PRESENCIAL EN EL AULA
Clases expositivas (CLE): 30 horas
Clases interactivas de laboratorio (CLIL): 20 horas
Tutor铆as en grupo (TI): 2 horas
Examen: 2
TRABAJO PERSONAL DEL ESTUDIANTE
Estudio aut贸nomo individual o en grupo: 51 horas
Resoluci贸n de ejercicios, redacci贸n de conclusiones u otros trabajos: 15 horas
Programaci贸n / experimentaci贸n u otros trabajos en ordenador/laboratorio: 30 horas
Antonio M. G贸mez Tato
Coordinador/a- Department
- Mathematics
- Area
- Geometry and Topology
- Phone
- 881813151
- antonio.gomez.tato [at] usc.es
- Category
- Professor: University Professor
Rebeca Garcia Fandi帽o
- Department
- Organic Chemistry
- Area
- Organic Chemistry
- rebeca.garcia.fandino [at] usc.es
- Category
- Professor: University Lecturer
Alejandro Seco Gonzalez
- Department
- Organic Chemistry
- Area
- Organic Chemistry
- alejandro.seco.gonzalez [at] usc.es
- Category
- 奇趣腾讯分分彩 Pre-doctoral Contract
| Monday | |||
|---|---|---|---|
| 12:00-13:00 | Grupo /CLE_01 | Spanish | Classroom 08. Louis Pasteur |
| Tuesday | |||
| 12:00-13:00 | Grupo /CLE_01 | Spanish | Classroom 08. Louis Pasteur |
| Wednesday | |||
| 13:00-14:00 | Grupo /CLE_01 | Spanish | Classroom 08. Louis Pasteur |
| 01.22.2025 10:00-20:00 | Grupo /CLE_01 | Classroom 04: James Watson and Francis Crick |
| 06.30.2025 10:00-20:00 | Grupo /CLE_01 | Classroom 03. Carl Linnaeus |